細(xì)胞RNAi技術(shù)
▏ RNAi技術(shù)服務(wù)
近年來(lái)的研究表明,將與mRNA同源的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導(dǎo)入細(xì)胞,可以使mRNA發(fā)生特異性的降解,從而抑制其相應(yīng)基因的表達(dá)。這種轉(zhuǎn)錄后基因沉默機(jī)制(Post-transcriptional gene silencing, PTGS)被稱為RNA干擾(RNAi)。由于RNAi具有高度的序列專一性,可以特異地使特定基因沉默,獲得功能喪失或降低突變,因此RNAi可以作為一種強(qiáng)有力的研究工具,用于功能基因組的研究。
科佰生物應(yīng)用國(guó)外知名公司的RNAi Designer平臺(tái),可對(duì)靶基因序列進(jìn)行干擾位置效應(yīng)評(píng)價(jià)和序列同源型分析,完成siRNA/miRNA多種序列的的設(shè)計(jì),并提供從siRNA合成、RNAi載體構(gòu)建到RNAi功能驗(yàn)證等全面的RNAi解決方案。
▏ siRNA合成服務(wù)
對(duì)于瞬時(shí)基因沉默實(shí)驗(yàn),化學(xué)合成siRNA的方法操作簡(jiǎn)便,容易獲得高水平的瞬時(shí)沉默效果,特異性強(qiáng)。我們通過(guò)嚴(yán)格設(shè)計(jì)來(lái)增強(qiáng)siRNA的專一性;針對(duì)某靶基因設(shè)計(jì)的3條siRNA可保證其中兩條的Knockdown效率達(dá)到75%(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
在RNAi效應(yīng)階段,siRNA雙鏈結(jié)合一個(gè)核酶復(fù)合物從而形成所謂RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex,RISC)。激活的RISC通過(guò)堿基配對(duì)定位到同源mRNA轉(zhuǎn)錄本上,并在距離siRNA 3’端12個(gè)堿基的位置切割mRNA。
▏ siRNA合成實(shí)驗(yàn)流程
1)根據(jù)序列信息,進(jìn)行化學(xué)合成;
2)純化及定量;
3)凍干處理;
4)細(xì)胞轉(zhuǎn)染預(yù)實(shí)驗(yàn),優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
5)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
6)RT-PCR或Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染后某一時(shí)間點(diǎn)靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對(duì)某靶基因設(shè)計(jì)的3條siRNA可保證其中2條的Knockdown效率達(dá)到75%(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
▏ shRNA構(gòu)建服務(wù)
構(gòu)建shRNA表達(dá)載體,實(shí)現(xiàn)shRNA在細(xì)胞中穩(wěn)定表達(dá),能夠彌補(bǔ)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染持續(xù)時(shí)間短的不足。
▏ shRNA構(gòu)建實(shí)驗(yàn)流程
1)mRNA序列分析;
2)引物設(shè)計(jì)及合成;
3)單鏈互補(bǔ)引物退火;
4)將片段克隆至載體;
5)測(cè)序以確保插入序列正確性;
6)細(xì)胞轉(zhuǎn)染預(yù)實(shí)驗(yàn),優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
7)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
8)RT-PCR或Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染后某一時(shí)間點(diǎn)靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對(duì)某靶基因設(shè)計(jì)的3條shRNA序列,在轉(zhuǎn)染效率>80%的前提下,我們保證至少有1個(gè)克隆可以達(dá)到70%轉(zhuǎn)錄水平的沉默效率。
▏ miRNA構(gòu)建服務(wù)
RNAi載體利用細(xì)胞內(nèi)源性的miRNA加工機(jī)制,相比傳統(tǒng)shRNA載體可更高效地表達(dá)RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu),并具有采用GFP進(jìn)行表達(dá)追蹤的優(yōu)點(diǎn)。每個(gè)基因設(shè)計(jì)的4條序列我們保證至少有2條可以達(dá)到至少70%轉(zhuǎn)錄水平的Knockdown效率(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
▏ miRNA構(gòu)建實(shí)驗(yàn)流程
1)針對(duì)特定基因,設(shè)計(jì)miR RNAi序列,合成該序列并退火生成雙鏈DNA;
2)將DNA與載體連接并轉(zhuǎn)化;
3)測(cè)序驗(yàn)證miRNA序列的正確性;
4)細(xì)胞轉(zhuǎn)染預(yù)實(shí)驗(yàn),優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
5)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
6)RT-PCR或Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染后某一時(shí)間點(diǎn)靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對(duì)某靶基因設(shè)計(jì)的3條miRNA序列,在轉(zhuǎn)染效率>80%的前提下,我們保證至少有1個(gè)克隆可以達(dá)到70%轉(zhuǎn)錄水平的沉默效率。
▏ 客戶提供
1)目的基因的Accession Number(Human、Mouse或Rat種屬)以及技術(shù)要求(包括OD和nmols的精確數(shù)量、純化類型和修飾要求等);
2)細(xì)胞株和詳細(xì)的細(xì)胞培養(yǎng)的操作步驟;
3)一抗(如果需要Western blot檢測(cè))。
▏ 服務(wù)說(shuō)明
1. RNAi技術(shù)服務(wù)不包括基因功能檢測(cè),如需檢測(cè),需要另外評(píng)估和收費(fèi);
2. 客戶可以提供實(shí)驗(yàn)原材料,也可以查找本公司模板庫(kù)、載體庫(kù)、細(xì)胞庫(kù),也可以由我們公司代購(gòu);